Мы не используем готовые модули, делаем синхронизацию индивидуально под клиента. Поэтому можно предусмотреть различные кастомизации. Например, передавать количество с конкретного склада, добавлять поля из заказов в МойСклад, передавать заказы только в определенном статусе, проводить обновление товаров по разным характеристикам и т.д.